Cilj izrade i odbrane master rada je da student pokaže samostalan i kreativan pristup u primeni stečenih praktičnih i teorijskih znanja iz odgovarajuće oblasti biomedicinskog inženjerstva. Osposobljavanje studenata za praćenje literature i istraživački rad.

Izradom i odbranom master rada studenti koji su završili studije treba da budu kompetentni da rešavaju realne probleme iz prakse kao i da nastave školovanje ukoliko se za to opredele. Diplomirani student stiče sposobnost rešavanja konkretnih problema uz upotrebu naučnih metoda i postupaka. Diplomirani studenti su sposobni da na odgovarajući način napišu i da prezentuju rezultate svog rada. Svršeni studenti ovog nivoa studija poseduju kompetenciju za praćenje i primenu novina u struci, kao i za saradnju sa lokalnim socijalnim i međunarodnim okruženjem.

Biomedicinski inženjering. Signali, sistemi and upravljanje u biomedicinskim sistemima. Biomehanika. Primenjeno računarsko inženjerstvo. Medicinska elektronika. Medicinska primena robotike.